12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2707 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 415 aa  811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  32.74 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  36.71 
 
 		 435 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  32.1 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  32.47 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  32.47 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  26.68 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  33.16 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  32.77 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  33.17 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  23.43 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>