146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2690 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  85.75 
 
 		 425 aa  695    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  86.59 
 
 		 423 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  88.24 
 
 		 422 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  83.18 
 
 		 427 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  90.31 
 
 		 423 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  85.98 
 
 		 426 aa  713    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  94.56 
 
 		 423 aa  779    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  90.45 
 
 		 420 aa  738    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  85.25 
 
 		 425 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  79.72 
 
 		 427 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  95.71 
 
 		 423 aa  758    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  87.29 
 
 		 424 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 422 aa  846    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  85.51 
 
 		 427 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  87.26 
 
 		 424 aa  734    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  76.44 
 
 		 439 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  82.15 
 
 		 379 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  65.26 
 
 		 412 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  48.21 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  47.31 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  44.23 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  44.36 
 
 		 411 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  45.64 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  45.64 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  44.68 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  44.66 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  44.39 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  45.18 
 
 		 401 aa  292  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  43.29 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  43.65 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  44.22 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  44.17 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  43.86 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  43.1 
 
 		 405 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  44.97 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  43.61 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  44.92 
 
 		 375 aa  279  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  45 
 
 		 400 aa  276  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  42.43 
 
 		 414 aa  276  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  43.94 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  39.81 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  45.29 
 
 		 373 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  43.32 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  43 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  43.98 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  42.04 
 
 		 415 aa  259  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  40.92 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  40.15 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  40.39 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  41.69 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  37.8 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  39.5 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  38.56 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  38.33 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  40.24 
 
 		 428 aa  213  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  38.99 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  38.08 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.12 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  32.93 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  38.08 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  44.86 
 
 		 408 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  38.64 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  38.25 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  39.67 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  39.57 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  38.46 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  38.91 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  41.28 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  40.98 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  37.68 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  37.37 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  37.37 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  37.37 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  43.68 
 
 		 190 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  34.47 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  35.75 
 
 		 465 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.1 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  34.59 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  34.59 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  32.12 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  34.2 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  34.21 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  34.21 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  29.95 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  32.97 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  33 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  31.47 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  34.21 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  30.81 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  35.11 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  34.39 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  32.24 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  35.94 
 
 		 450 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  32.65 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  31.48 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  28.95 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  25.78 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  31.72 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  32.38 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>