More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2444 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  679  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  68.9 
 
 
328 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  65.78 
 
 
324 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  64.07 
 
 
358 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  66.56 
 
 
326 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  64.42 
 
 
323 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  67.22 
 
 
326 aa  415  1e-115  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.41 
 
 
328 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.59 
 
 
328 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.55 
 
 
328 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.41 
 
 
328 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.88 
 
 
330 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.72 
 
 
339 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.15 
 
 
327 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  49.84 
 
 
328 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.73 
 
 
336 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  50 
 
 
327 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.51 
 
 
330 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  48.31 
 
 
323 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.33 
 
 
328 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.34 
 
 
336 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.18 
 
 
325 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.18 
 
 
327 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  49.67 
 
 
331 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.44 
 
 
339 aa  286  3e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.47 
 
 
314 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.01 
 
 
328 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.34 
 
 
344 aa  283  2e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.45 
 
 
335 aa  283  2e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.49 
 
 
324 aa  283  3e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.19 
 
 
333 aa  283  4e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.67 
 
 
330 aa  282  4e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.67 
 
 
330 aa  282  4e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.97 
 
 
349 aa  282  6e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.49 
 
 
339 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  45.81 
 
 
334 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.77 
 
 
333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.79 
 
 
328 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.54 
 
 
325 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.34 
 
 
345 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.34 
 
 
345 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.77 
 
 
360 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.97 
 
 
334 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.25 
 
 
331 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.9 
 
 
324 aa  273  4e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.79 
 
 
322 aa  272  5e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.3 
 
 
353 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 
322 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46 
 
 
304 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45 
 
 
310 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.03 
 
 
331 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.59 
 
 
330 aa  270  3e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.03 
 
 
331 aa  270  3e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.84 
 
 
344 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.86 
 
 
341 aa  269  6e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.15 
 
 
355 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  46.05 
 
 
322 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.79 
 
 
332 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.38 
 
 
333 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.34 
 
 
336 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  45.6 
 
 
335 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.48 
 
 
322 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.38 
 
 
325 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  45.63 
 
 
322 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.15 
 
 
322 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  45.07 
 
 
327 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.07 
 
 
326 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  41.37 
 
 
334 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.59 
 
 
343 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  43.64 
 
 
341 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.38 
 
 
339 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 
335 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.04 
 
 
331 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.62 
 
 
334 aa  262  5e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.69 
 
 
324 aa  262  7e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.14 
 
 
317 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.42 
 
 
339 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  43.81 
 
 
334 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.33 
 
 
333 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.31 
 
 
330 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  43.04 
 
 
324 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  41.56 
 
 
329 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  43.57 
 
 
324 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.14 
 
 
327 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.87 
 
 
324 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  43.33 
 
 
330 aa  259  5e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.81 
 
 
317 aa  259  5e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.06 
 
 
335 aa  259  5e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.11 
 
 
335 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.04 
 
 
348 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  42.39 
 
 
324 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.17 
 
 
320 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  42.23 
 
 
335 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.24 
 
 
318 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.67 
 
 
336 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  43.65 
 
 
330 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  43.08 
 
 
327 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>