More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2422 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  85.32 
 
 		 437 aa  798    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1991  type II citrate synthase  75 
 
 		 433 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179438  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  74.31 
 
 		 433 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4350  type II citrate synthase  83.49 
 
 		 436 aa  783    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2146  type II citrate synthase  74.77 
 
 		 433 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  74.08 
 
 		 433 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  71.82 
 
 		 432 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  77.86 
 
 		 433 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  77.06 
 
 		 433 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  75.29 
 
 		 437 aa  703    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  73.39 
 
 		 433 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  75.52 
 
 		 437 aa  706    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2422  type II citrate synthase  100 
 
 		 436 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  74.77 
 
 		 433 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  83.72 
 
 		 436 aa  793    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  85.09 
 
 		 436 aa  796    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  74.13 
 
 		 432 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  74.31 
 
 		 433 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  76.83 
 
 		 433 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  88.07 
 
 		 436 aa  821    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  73.39 
 
 		 433 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  73.85 
 
 		 433 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  83.26 
 
 		 436 aa  785    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  82.8 
 
 		 437 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1822  type II citrate synthase  74.77 
 
 		 433 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.724589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  73.85 
 
 		 433 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  73.39 
 
 		 433 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  73.39 
 
 		 433 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  88.07 
 
 		 436 aa  821    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  74.54 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  87.84 
 
 		 436 aa  819    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  84.17 
 
 		 436 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  67.36 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  65.97 
 
 		 433 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  67.06 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 430 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  65.83 
 
 		 434 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  66.44 
 
 		 434 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  65.14 
 
 		 434 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  65.21 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  64.91 
 
 		 434 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  64.8 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  65.89 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  64.71 
 
 		 436 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  64.29 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  64.29 
 
 		 429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  62.84 
 
 		 431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  63.59 
 
 		 429 aa  597  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  65.79 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  66.11 
 
 		 446 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  65.16 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  63.36 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  64.75 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  65.06 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  66.11 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  64.29 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  64.87 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  64.29 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  63.82 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  64.06 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  63.59 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  64.52 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  65.55 
 
 		 430 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  63.82 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  64.8 
 
 		 433 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  64.99 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  64.29 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  62.44 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  65.17 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  63.82 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  62.8 
 
 		 428 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  64.79 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  62.8 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  62.9 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  63.13 
 
 		 454 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  61.25 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  62.56 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  63.82 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  63.05 
 
 		 438 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  64.25 
 
 		 436 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  61.29 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  63.59 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  64.98 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  65.11 
 
 		 445 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  63.36 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  61.24 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  65.57 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  65.81 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  60.89 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>