More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2386 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2386  ATPase  100 
 
 
306 aa  610  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  76.47 
 
 
306 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  78.03 
 
 
306 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  75.08 
 
 
306 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  75.08 
 
 
306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.36 
 
 
306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  78.36 
 
 
306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.08 
 
 
306 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  75.74 
 
 
310 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  72 
 
 
306 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  69.33 
 
 
349 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  60.47 
 
 
303 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  61.95 
 
 
315 aa  348  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  58.88 
 
 
315 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  59.12 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  61.72 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.79 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  56.72 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  61.07 
 
 
308 aa  335  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  57.25 
 
 
315 aa  332  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.18 
 
 
317 aa  331  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  57.81 
 
 
306 aa  330  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  60.44 
 
 
317 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  57.61 
 
 
305 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  60.07 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  57.04 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  56.68 
 
 
304 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.86 
 
 
308 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  60.14 
 
 
305 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  60.14 
 
 
305 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  60 
 
 
305 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  59.39 
 
 
305 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  56.16 
 
 
303 aa  322  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.28 
 
 
300 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  59.39 
 
 
305 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  55.23 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  56.52 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  55.07 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  56.16 
 
 
303 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  54.51 
 
 
303 aa  319  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.27 
 
 
323 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.27 
 
 
323 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  52.69 
 
 
306 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  55.23 
 
 
315 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.12 
 
 
303 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  60.62 
 
 
321 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  59.32 
 
 
303 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.64 
 
 
329 aa  316  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  59.7 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  49.83 
 
 
305 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  59.32 
 
 
313 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  59.32 
 
 
303 aa  315  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.41 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  54.96 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  56.16 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  54.39 
 
 
315 aa  311  7.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  57.03 
 
 
303 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  57.03 
 
 
303 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  56.04 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.2 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  60.64 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  51.96 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  48.24 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  53.6 
 
 
335 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.32 
 
 
335 aa  296  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 
306 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 
306 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
306 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  50.33 
 
 
305 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  55.05 
 
 
317 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.4 
 
 
310 aa  292  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  50 
 
 
305 aa  292  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.15 
 
 
314 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  53.5 
 
 
326 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  46.35 
 
 
308 aa  288  9e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.88 
 
 
313 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.65 
 
 
341 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.47 
 
 
325 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
302 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  53.33 
 
 
310 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.21 
 
 
347 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  49.17 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  50.18 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.29 
 
 
321 aa  285  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.35 
 
 
316 aa  285  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  51.97 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  49.19 
 
 
323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.28 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.19 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  43.96 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  51.79 
 
 
350 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.07 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.21 
 
 
314 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.07 
 
 
337 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.53 
 
 
319 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  53.62 
 
 
313 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  44.77 
 
 
309 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.35 
 
 
309 aa  279  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
351 aa  279  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.43 
 
 
310 aa  278  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>