More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2281 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  41.92 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  34.72 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.76 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.22 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  34.88 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.22 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.22 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.22 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.22 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  30.93 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>