More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2157 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  874    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  72.07 
 
 		 442 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  68.56 
 
 		 448 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  69.03 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  67.87 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  59.39 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  59.25 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  53.27 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  52.8 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  52.57 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  51.81 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  50.82 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  50.97 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  52.17 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  51.64 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  49.64 
 
 		 441 aa  415  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  50.23 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  48.94 
 
 		 436 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  52.35 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  49.77 
 
 		 442 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  49.28 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  48.82 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  52.79 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  46.68 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  47.9 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  42.66 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  41.31 
 
 		 426 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  43.33 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  38.26 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  41 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  39.44 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  41.96 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.37 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  41.92 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.37 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 		 447 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  41.34 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  41.04 
 
 		 432 aa  288  9e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  42.72 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  40.14 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  37.09 
 
 		 436 aa  285  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  40.1 
 
 		 443 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  40.1 
 
 		 443 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  39.91 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  40.48 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  40.23 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  39.63 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  40.38 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  38.16 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  39.9 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.35 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  39.15 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  40 
 
 		 432 aa  269  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  35.53 
 
 		 432 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  36.59 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  39.43 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.9 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  38.08 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  37.7 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  38.75 
 
 		 431 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  39.76 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.13 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  37.88 
 
 		 425 aa  262  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  40.23 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  38.5 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  41.73 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  39.63 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  34.94 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.18 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  36.3 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  32 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  36.16 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  35.9 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  36.39 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.19 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  35.21 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  34.69 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  30.57 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  34.52 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  34.67 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  38.82 
 
 		 424 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  32.27 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  38.82 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  33.02 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  41.42 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  32.28 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  35.65 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  34.51 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.29 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.29 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  33.49 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  32.01 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  33.41 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  32.08 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.08 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  31.06 
 
 		 447 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  31.06 
 
 		 447 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>