More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2114 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  85.28 
 
 		 325 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  85.28 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  78 
 
 		 304 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  70.15 
 
 		 328 aa  484  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  71.34 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  63.55 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  48.62 
 
 		 327 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.33 
 
 		 327 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  49.69 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.22 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.66 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.33 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.66 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.64 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.78 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.36 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.12 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.52 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50.83 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.33 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  49.16 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.43 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.99 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  48 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.97 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  44.51 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.29 
 
 		 335 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.67 
 
 		 335 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.85 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.99 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.57 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.71 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  48.63 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.09 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.8 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.49 
 
 		 324 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.48 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  45.98 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  47.06 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  45.97 
 
 		 329 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.33 
 
 		 325 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  48.49 
 
 		 322 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.68 
 
 		 336 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.68 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  48.36 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.35 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  46.28 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.85 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.09 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.09 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.85 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.77 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.64 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.77 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  42.77 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.88 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  49.5 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.38 
 
 		 328 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  48.66 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.27 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  47.47 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  45 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  48.34 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  47.39 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.08 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.71 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.64 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.89 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.25 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  47.66 
 
 		 332 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.87 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.89 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  44.33 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  45.25 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.57 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.56 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.23 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.13 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  41.98 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.68 
 
 		 343 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.1 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.64 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.74 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  45 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  42.53 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.92 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.57 
 
 		 331 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  45.6 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.81 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  43.85 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  45.36 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.21 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.28 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  42.99 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>