124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1929 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  46.48 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  44.97 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  36.99 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  36.41 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  37.31 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  33.03 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  39.68 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  30.57 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.08 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  38.4 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  35.37 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  35.37 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  39.39 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  39.39 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  34.15 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.18 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  30.66 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  29.23 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  32.41 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  37.88 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  31.61 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  32.87 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.47 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  37.12 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  36 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  33.33 
 
 		 133 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  30.95 
 
 		 239 aa  72  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  33.33 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  28.95 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  32.54 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  25.11 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  30.28 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  37.63 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  43.68 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  31.3 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  28.25 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  27.54 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  25.84 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  33.33 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  34.55 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  32.73 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.14 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  24.18 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.11 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  33.62 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  34.07 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  30.51 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  34.75 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  31.87 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  34.07 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.23 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.87 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  26.46 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  26.98 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  33.64 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.64 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  36.22 
 
 		 138 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  36.22 
 
 		 138 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  26.46 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  35.8 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  27.64 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  30.77 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  30 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  31.5 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.32 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0691  hypothetical protein  33.52 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00140732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0751  hypothetical protein  33.52 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  32.41 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  31.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  34.57 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  29.09 
 
 		 338 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  26.29 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  28.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  28.37 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  43.4 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  29.17 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  24.19 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.83 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  30.23 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  27.78 
 
 		 150 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  38.27 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  32.06 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  29.23 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>