28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1916 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  100 
 
 		 307 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  50.39 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  41.5 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  43.33 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  32.58 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  31.51 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  33.33 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  31.84 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  31.84 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  30.73 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  27.51 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  29.63 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  33.53 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  28.49 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4180  hypothetical protein  29.38 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.171725  normal  0.246945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  34.3 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4181  hypothetical protein  35.51 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120409  normal  0.252411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  28.74 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  27.59 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  31.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  31.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  31.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  31.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1139  RecT protein  27.22 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  27.22 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  25.16 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  22.61 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>