178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1882 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 443 aa  886    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  58.92 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  61.87 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  57.17 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  52.12 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  36.26 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  36.9 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  34.77 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  35.96 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  34.56 
 
 		 450 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  34.62 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  35.28 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  36.64 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  33.78 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  35.63 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  33.69 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 		 456 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  34.87 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  35.18 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  31.49 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  34.06 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  34.53 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  30.66 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  34.59 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  31.31 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  37.44 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.65 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  36.65 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.22 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  37 
 
 		 458 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  34.71 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  35.86 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  33 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  33.03 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  33.89 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  34.53 
 
 		 494 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  35.17 
 
 		 456 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  33.7 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  38.15 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  33.79 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  32.5 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  33.01 
 
 		 458 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  35.57 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  37.33 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  34.01 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  37.33 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  38.86 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  32.71 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  31.98 
 
 		 483 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.61 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  33.19 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.22 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.29 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  33.96 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  32.49 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.13 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.56 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.52 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.5 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.7 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  35.61 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31.26 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  31.75 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  33.25 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.39 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.89 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.96 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 		 441 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.38 
 
 		 471 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.86 
 
 		 461 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.72 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.46 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.98 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  32.59 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.69 
 
 		 485 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  35.94 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.23 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  36.06 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  34.11 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.52 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  27.63 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  34.14 
 
 		 471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.34 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  32.08 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.96 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  30.82 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.37 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.77 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.64 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  30.05 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.56 
 
 		 487 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>