More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1853 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  96.36 
 
 		 385 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 385 aa  796    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  71.35 
 
 		 386 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  68.15 
 
 		 385 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  68.15 
 
 		 385 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  68.15 
 
 		 385 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  68.5 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  62.77 
 
 		 382 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  62.5 
 
 		 382 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  62.5 
 
 		 382 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  63.3 
 
 		 382 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  61.97 
 
 		 383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  56.62 
 
 		 378 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  46.28 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  39.72 
 
 		 402 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  41.26 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  37.6 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  36.56 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  38.22 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  40.91 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.9 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  38.33 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.22 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.13 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  35.14 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 		 410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.41 
 
 		 421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.94 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.08 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  33.67 
 
 		 425 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.25 
 
 		 422 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.25 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.97 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.54 
 
 		 414 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  34.56 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.06 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.14 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  33.92 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.16 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.45 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.98 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  31.84 
 
 		 711 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  31.44 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  28.84 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 		 421 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.45 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  31.89 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.83 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  31.13 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.15 
 
 		 447 aa  152  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.94 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.83 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.06 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.64 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  32.23 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  30.37 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  30.65 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.98 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  31.4 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.7 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  31.93 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  31.4 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 		 384 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.15 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  31.1 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.46 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.79 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.7 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 		 395 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  29.64 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  27.78 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  33.44 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  31 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  30.15 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  32.44 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  30.39 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.09 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  31.12 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  30.41 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.67 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>