154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1841 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  74.65 
 
 
228 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  73.73 
 
 
228 aa  318  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  66.04 
 
 
237 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  65.85 
 
 
209 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  54.87 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  57.07 
 
 
212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  52.61 
 
 
208 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  52.61 
 
 
208 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  52.08 
 
 
222 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  52.08 
 
 
222 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  48.73 
 
 
204 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  51.31 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  48.74 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  45.5 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  52.6 
 
 
211 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.26 
 
 
257 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  45.69 
 
 
204 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  48.98 
 
 
202 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  45.79 
 
 
217 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  43.56 
 
 
235 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  46.15 
 
 
206 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  51.53 
 
 
211 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  47.4 
 
 
210 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  52.55 
 
 
211 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  52.04 
 
 
211 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  44.13 
 
 
215 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  47.69 
 
 
215 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  44.79 
 
 
203 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  43.75 
 
 
210 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  42.5 
 
 
208 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  47.12 
 
 
200 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  47.12 
 
 
200 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  46.43 
 
 
204 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  45.5 
 
 
211 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  45.36 
 
 
202 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  39.82 
 
 
238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  43.23 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  42.27 
 
 
201 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  47.92 
 
 
214 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  46.07 
 
 
202 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  42.27 
 
 
233 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  40.48 
 
 
215 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  41.24 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  39.81 
 
 
215 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  42.49 
 
 
203 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  39.91 
 
 
237 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  41.2 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  41 
 
 
205 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  38.54 
 
 
202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  39.9 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  35.57 
 
 
204 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  39.58 
 
 
198 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  36.6 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  35.09 
 
 
217 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  41.45 
 
 
233 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  51.04 
 
 
109 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  37.64 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  31.74 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  33.55 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  31.48 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  25.59 
 
 
299 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.59 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  29.38 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  24 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  30.87 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  30.28 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  23.49 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  28.07 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.03 
 
 
287 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  25.32 
 
 
289 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  24.85 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  26.01 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  27.21 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  25.33 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  24.85 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  26.84 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  25.15 
 
 
290 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  26.8 
 
 
302 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  29.2 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  26.83 
 
 
287 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.5 
 
 
311 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  25.17 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  26.7 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0017  hypothetical protein  25.69 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  31.08 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  28.03 
 
 
309 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  28.08 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.54 
 
 
306 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  25.7 
 
 
311 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  23.87 
 
 
191 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  25.95 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  27.39 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  20.81 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2185  hypothetical protein  25.77 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1873  protein of unknown function DUF161  28.86 
 
 
288 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.83834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  32.21 
 
 
304 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  29.87 
 
 
281 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>