More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1808 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  934    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.77 
 
 		 446 aa  591  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.31 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.85 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  61.85 
 
 		 447 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.92 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.79 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  56.06 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  53.44 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  47.2 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  38.72 
 
 		 485 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  38.58 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  52.45 
 
 		 293 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  35.08 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  35.8 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  34.73 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 514 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  35.96 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 489 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  40 
 
 		 740 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 553 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  35.92 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  35.92 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  35.92 
 
 		 575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 748 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 1168 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  37.18 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0789  histidine kinase  42.72 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  38.18 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 490 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  35.81 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  35.95 
 
 		 619 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  36.78 
 
 		 680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 700 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  34.76 
 
 		 683 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 703 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  37.84 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 684 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  38.01 
 
 		 670 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 707 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  35.54 
 
 		 680 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 541 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  37.84 
 
 		 671 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  35.77 
 
 		 687 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 450 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 		 463 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 		 463 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 492 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 370 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  36.13 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  38.25 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 799 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  36.44 
 
 		 1809 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 363 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 671 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 347 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 795 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 703 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 795 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 795 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 801 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 598 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  34.84 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 509 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 665 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  33.48 
 
 		 645 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.53 
 
 		 598 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 373 aa  126  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  36.62 
 
 		 795 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  37 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 535 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 546 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>