More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1800 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
492 aa  999    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  69.92 
 
 
484 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  67.28 
 
 
484 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  69.39 
 
 
484 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  73.24 
 
 
479 aa  626  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  64.84 
 
 
499 aa  594  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  70.79 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  66.14 
 
 
509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  65.64 
 
 
481 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  50.67 
 
 
501 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  51 
 
 
452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  49.54 
 
 
494 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  54.31 
 
 
470 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  47.82 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  49.24 
 
 
506 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  47.64 
 
 
454 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  48.72 
 
 
455 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  49.53 
 
 
453 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  46.61 
 
 
504 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  47.24 
 
 
465 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  46.88 
 
 
470 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  45.45 
 
 
453 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  46.76 
 
 
466 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  42.99 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  46.24 
 
 
459 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  39.19 
 
 
441 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  43.31 
 
 
462 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  39.19 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  43.23 
 
 
465 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  43.23 
 
 
465 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  41.88 
 
 
451 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  42.28 
 
 
448 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41.81 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  41.23 
 
 
451 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  41.81 
 
 
451 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  41.09 
 
 
450 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  36.65 
 
 
442 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  41.33 
 
 
451 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  41.33 
 
 
451 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  36.43 
 
 
459 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  41.65 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  42.42 
 
 
460 aa  299  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 
493 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  36.04 
 
 
493 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  37.82 
 
 
453 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  37.56 
 
 
489 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  38.32 
 
 
514 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  36.14 
 
 
513 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  40.24 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  37.78 
 
 
476 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  39.38 
 
 
469 aa  276  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  38.25 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.76 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  37.33 
 
 
461 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  38.62 
 
 
477 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  38.14 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  37.05 
 
 
461 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  37.67 
 
 
459 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  36.93 
 
 
464 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  38.06 
 
 
448 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  38.06 
 
 
448 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  35.89 
 
 
464 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  39.46 
 
 
472 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  37.5 
 
 
448 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  36.74 
 
 
467 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  36.38 
 
 
457 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  37.76 
 
 
454 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  34.75 
 
 
468 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  37.74 
 
 
460 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  36.98 
 
 
459 aa  247  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  37.01 
 
 
460 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  37.01 
 
 
460 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  36.51 
 
 
459 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  35.87 
 
 
443 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  35.92 
 
 
469 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  31.85 
 
 
453 aa  239  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 
461 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  36.17 
 
 
457 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.17 
 
 
457 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  35.65 
 
 
463 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
442 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  35.32 
 
 
441 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  35.97 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.7 
 
 
441 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  34.56 
 
 
453 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  36.24 
 
 
428 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 
443 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 
447 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 
443 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  34.42 
 
 
443 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  35.06 
 
 
443 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 
443 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  33.65 
 
 
443 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  31.63 
 
 
431 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  35.06 
 
 
443 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  34.82 
 
 
443 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  35.06 
 
 
443 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  35.06 
 
 
443 aa  226  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  35.06 
 
 
443 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>