More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1762 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1762  (acyl-carrier protein) S-malonyltransferase  100 
 
 
303 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5368  (Acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  61.67 
 
 
302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0073  Acyl transferase  50.98 
 
 
307 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1849  (Acyl-carrier protein) S-malonyltransferase  45.25 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2890  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  39.6 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.026871  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1140  malonyl-CoA ACP transacylase  33.12 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.678313  normal  0.244808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4014  Acyl transferase region  39.07 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1075  malonate decarboxylase, epsilon subunit  37 
 
 
306 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0031  acyl transferase domain-containing protein  36.93 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0030  acyl transferase domain-containing protein  36.13 
 
 
307 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0172  acyl transferase domain-containing protein  37.1 
 
 
308 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1514  malonyl CoA-ACP transacylase  32.08 
 
 
319 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3186  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3157  acyl transferase domain-containing protein  34.95 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4292  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase-like protein  36.36 
 
 
304 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1002  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.67 
 
 
310 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2182  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.33 
 
 
310 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491631  normal  0.0479122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.6 
 
 
2284 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3469  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.51 
 
 
324 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122116  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1801  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2803  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0531  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  32.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.720629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2906  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  32.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4234  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  33.33 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1122  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2791  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.67 
 
 
310 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2478  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.67 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0829  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.64 
 
 
310 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0642  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.67 
 
 
310 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0052  acyl transferase domain protein  35.6 
 
 
307 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal  0.113572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1491  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.74 
 
 
324 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2852  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.67 
 
 
310 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0331918  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0611  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.57 
 
 
299 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000665754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0998  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.37 
 
 
309 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2264  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  31.47 
 
 
309 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2911  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31 
 
 
311 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6851  acyl transferase domain-containing protein  33.12 
 
 
309 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  28.33 
 
 
2414 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1276  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30 
 
 
310 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00229731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2369  acyl transferase  33 
 
 
301 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.0195741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1073  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  31.33 
 
 
311 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2429  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  31.25 
 
 
311 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3194  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.93 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1051  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  32.99 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.418827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1087  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  29.35 
 
 
310 aa  99  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.930156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1718  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.67 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1327  Acyl transferase  35.96 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.37 
 
 
314 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0947  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  33.1 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010445  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0981  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.102114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0871  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.39 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0340  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.73 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000186128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0013  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.73 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02708  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.54 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0916  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0221  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.96 
 
 
343 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2625  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.52 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000014528  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.29 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0711  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.61 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000405607  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1059  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.68 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000649823  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1731  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.9 
 
 
319 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4573  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  30.42 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124342  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1179  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.57 
 
 
312 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000714378  decreased coverage  0.00161163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  29.65 
 
 
2314 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10340  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  34.63 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  30.04 
 
 
2531 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0520  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  29.41 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000508998  hitchhiker  0.00314057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3951  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2205  putative (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  31.25 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000728729 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1590  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  28.27 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2327  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.45 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1234  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.58 
 
 
317 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0952866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1608  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.16 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0515  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.57 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  decreased coverage  0.00276258 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0794  putative malonyl CoA-acylcarrier protein transacylase  31.65 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1275  putative malonyl CoA-acylcarrier protein transacylase  31.65 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3992  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.72 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2041  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.75 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000168323  normal  0.0169679 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0740  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  25.99 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000069943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1606  Acyl transferase  27.8 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1349  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.81 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  24.64 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  24.64 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1390  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.94 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2466  putative malonyl-CoA:acyl carrier protein malonyltransferase  30.26 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000980715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.17 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1807  (Acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  33.85 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  0.0201213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  30.47 
 
 
1272 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2986  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.88 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0669081  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1582  malonyl-CoA-[acyl-carrier-protein] transacylase  29.41 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00648644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0603  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.41 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142237  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0435  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.35 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3772  acyl transferase domain-containing protein  31.29 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.83 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0744  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.86 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397219  normal  0.740217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  31.96 
 
 
1934 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1345  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.81 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1165  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  35.76 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.033586  normal  0.190387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>