136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1632 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 429 aa  881    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  47.92 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  45.73 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  45.73 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  44.69 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  44.1 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  43.49 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  42.05 
 
 		 434 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  42.58 
 
 		 407 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  37.76 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  37.5 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  38.92 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  36.94 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  34.79 
 
 		 445 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  34.55 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  36.08 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  35.39 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  35.39 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  35.39 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  34.72 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.84 
 
 		 444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  35.36 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  33.5 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  30.73 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  35.09 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  30.48 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  30.23 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  33.42 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  34.92 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  35.49 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  31.87 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.52 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  31.25 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  31.03 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  31.07 
 
 		 524 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29.1 
 
 		 417 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  30.57 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  29.33 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  29.33 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.77 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.25 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  27.52 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  30.1 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.5 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  26.96 
 
 		 420 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.61 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  29.92 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  27.11 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  28.42 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  30.36 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.53 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  29.49 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  28.68 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  25.7 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  27.37 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  23.58 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  32.31 
 
 		 225 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  26.39 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  28.92 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  27.22 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  27.62 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  28.06 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  27.82 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  24.61 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.41 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.21 
 
 		 544 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  26.8 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  26.61 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.66 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.66 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  25.4 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24.25 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  24.42 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  28.89 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  23.27 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  24.87 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  24.87 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  26.46 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.52 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  23.42 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  24.4 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  22.25 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  23.14 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  28.69 
 
 		 264 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 859 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 833 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 833 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2495  phage portal protein, HK97 family  35.05 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0490776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  34.06 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  35.48 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  23.56 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  25.81 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  25.34 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  24.86 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.47 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>