287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1506 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 271 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  72.83 
 
 		 266 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  72.45 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  65.54 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  62.78 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  75.11 
 
 		 224 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  72.35 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3380  cytochrome c assembly protein  66.24 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  69.05 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  50.35 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  52.55 
 
 		 255 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  41.53 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  38.8 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  43.12 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  42.34 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  45.54 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  42.48 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  42.48 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  42.48 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  41.57 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  44.64 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  44.64 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  43.4 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  43.5 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  43.5 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  39.07 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  44.2 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  42.17 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  33.98 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  38.43 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  38.28 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  37.13 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  44.34 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  44.34 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  41.28 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  37.68 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  36.71 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  36.71 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  36.45 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  30.5 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  35.89 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  45.54 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  35.09 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  39.31 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  34.94 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  29 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  41.3 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  33.02 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  33.74 
 
 		 264 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  33.94 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  40.36 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  35.84 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  39.76 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  23.95 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  35.4 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  37.18 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  35.4 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  35.4 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  36.99 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  36.73 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  36.73 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  35.9 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  32.95 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  35.8 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  25.78 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  29.18 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  36.25 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.54 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  52.58 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  32.52 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  25.61 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  29.63 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  33.75 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  24.66 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  33.75 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  34.29 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  33.54 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  27.4 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  24.17 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  33.54 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  35.14 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  24.53 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.59 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  29.6 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  29.6 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2895  putative cytochrome C assembly protein  29.6 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3850  putative cytochrome C assembly protein  29.6 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000010196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  24.55 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>