More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1493 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  55.14 
 
 
195 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  53.07 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  51.35 
 
 
189 aa  164  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  49.67 
 
 
172 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.48 
 
 
195 aa  160  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  51.48 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  46.2 
 
 
184 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.77 
 
 
182 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  48.82 
 
 
180 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.38 
 
 
195 aa  141  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  40 
 
 
182 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  39.71 
 
 
182 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  32.14 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  42.97 
 
 
171 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  38.03 
 
 
180 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 
175 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  40.51 
 
 
180 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  41.18 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  39.26 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  39.18 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  40.31 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  39.53 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  39.53 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  38.76 
 
 
183 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  38.76 
 
 
184 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.62 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  37.21 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  36.25 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  39.53 
 
 
182 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  34.88 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  34.88 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  34.88 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  34.88 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  34.88 
 
 
186 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  34.88 
 
 
186 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  34.88 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  37.32 
 
 
165 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.73 
 
 
187 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.54 
 
 
188 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  34.73 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  35.4 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.33 
 
 
183 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  36.97 
 
 
164 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.82 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  30.36 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30.9 
 
 
173 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  28.81 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.51 
 
 
173 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  38.3 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  28.81 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  34.09 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.09 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.09 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  34.09 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28.25 
 
 
173 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  37.01 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  38.84 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  37.72 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  33.07 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.44 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.66 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  38.98 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.35 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  33.88 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  32.8 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.13 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  36.28 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  30.39 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.94 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.07 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.78 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.54 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.92 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.92 
 
 
403 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  36.61 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  37.1 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  34.75 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.75 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  34.96 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  30.06 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  33.59 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.93 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  34.81 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  35.48 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  37.72 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  36.72 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>