More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1417 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  100 
 
 		 458 aa  927    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  63.7 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  61.85 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  56.16 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  50.79 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  50.82 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  50.73 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  51.45 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  46.82 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  51.83 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  47.85 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  49.13 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  49.13 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  47.75 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  46.14 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  46.74 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  48.28 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  46.14 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  46.26 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  48.5 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  47.96 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  44.27 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  49.25 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  45.02 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  42.3 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  40.97 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.16 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.04 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  38.46 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  40.98 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.44 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  42.16 
 
 		 411 aa  286  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  40.8 
 
 		 400 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  43.63 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  40.74 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.2 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.76 
 
 		 405 aa  283  6.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40.1 
 
 		 389 aa  280  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.29 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.81 
 
 		 390 aa  277  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.19 
 
 		 388 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  44.24 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  42.09 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.62 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.39 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.39 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.07 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.46 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  41.08 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.6 
 
 		 393 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  41.81 
 
 		 396 aa  272  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  42.42 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  41.89 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  41.63 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  40.64 
 
 		 402 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  40.2 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  40.67 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  40.67 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  40.15 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  38.13 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.08 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  40.51 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.78 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  38.46 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  35.99 
 
 		 395 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.05 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  41.09 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  39.11 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  40.35 
 
 		 396 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.09 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  35.99 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.74 
 
 		 390 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  40.43 
 
 		 410 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  37.1 
 
 		 381 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  42.03 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0090  amidohydrolase  40.05 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0093  amidohydrolase  40.05 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.76 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.52 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.26 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  37.97 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.64 
 
 		 408 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  39.8 
 
 		 395 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  40.81 
 
 		 389 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.36 
 
 		 381 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  41.95 
 
 		 392 aa  262  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.84 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  45.63 
 
 		 396 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  40.34 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  40.46 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.92 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  36.74 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  37.19 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  39.51 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  39.45 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  39.66 
 
 		 395 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  37.31 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  39.5 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  40.91 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>