More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1369 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  61.85 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  50.93 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  50.27 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  51.72 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  47.81 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  34.44 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  37.16 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  38.1 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  37.83 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  37.05 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  34.17 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  38.1 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  34.76 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.91 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  36.14 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  35.12 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  35.04 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  34.43 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  34.75 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  38.12 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  37.5 
 
 		 420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  30 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  34.09 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  35.36 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  34.03 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  34.03 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  34.65 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  28.96 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  34.96 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  34.86 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  34.04 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  34.68 
 
 		 376 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  32.55 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  32.21 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  31.57 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  34.62 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  33.44 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  30.93 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  33.69 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.21 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  35.76 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  30.79 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  30.87 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.1 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  32.88 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  28.72 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.89 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  32.79 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.89 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  35.4 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  36.64 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.13 
 
 		 372 aa  136  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  28.36 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.99 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  33.24 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  34.56 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  31.25 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  37.28 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.8 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  31.17 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  32.23 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  29.83 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.08 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  30.15 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  28.16 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  28.17 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  30.83 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  33.12 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  30.93 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.16 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.42 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28.53 
 
 		 422 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  30.38 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.29 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  30.45 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.5 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.25 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.72 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  29.4 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  28.95 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  24.09 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  32.37 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  26.34 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  23.77 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.39 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  27.03 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  26.38 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.18 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.65 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  31.37 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.5 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>