More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1309 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  58.63 
 
 		 720 aa  798    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 819 aa  1644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  54.33 
 
 		 829 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  32.35 
 
 		 745 aa  324  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  32.74 
 
 		 763 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  30.6 
 
 		 775 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  30.5 
 
 		 780 aa  303  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  29.67 
 
 		 773 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  30.77 
 
 		 775 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  29.51 
 
 		 751 aa  298  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  29.3 
 
 		 774 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  28.42 
 
 		 801 aa  263  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  27.77 
 
 		 803 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  45.71 
 
 		 833 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  29.02 
 
 		 772 aa  241  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  43.92 
 
 		 681 aa  225  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  38.02 
 
 		 751 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  36.72 
 
 		 767 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  38.08 
 
 		 686 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 766 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  26.74 
 
 		 733 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  36.1 
 
 		 793 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  33.65 
 
 		 776 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  36.48 
 
 		 756 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  26.34 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  33.65 
 
 		 733 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 738 aa  158  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.49 
 
 		 750 aa  158  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.17 
 
 		 793 aa  157  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  24.2 
 
 		 789 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  27.25 
 
 		 781 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 781 aa  152  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.02 
 
 		 783 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  23.42 
 
 		 752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.3 
 
 		 641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  31.5 
 
 		 660 aa  149  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  30.11 
 
 		 724 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.21 
 
 		 804 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  29.58 
 
 		 705 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  29.49 
 
 		 706 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  29.01 
 
 		 705 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 		 703 aa  140  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  26.31 
 
 		 736 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  23.54 
 
 		 728 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  29.91 
 
 		 697 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  27.1 
 
 		 807 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  28.44 
 
 		 805 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  30.87 
 
 		 711 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  31 
 
 		 710 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 		 654 aa  138  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 		 650 aa  138  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  28.98 
 
 		 707 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  27.16 
 
 		 654 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  29.26 
 
 		 704 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 714 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  26.56 
 
 		 814 aa  137  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 740 aa  137  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  25.48 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.43 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  27.73 
 
 		 904 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  29.66 
 
 		 705 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  29.26 
 
 		 702 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  32.14 
 
 		 634 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 660 aa  135  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  30.52 
 
 		 681 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  27.97 
 
 		 710 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 658 aa  134  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  32.09 
 
 		 787 aa  134  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 902 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  31.16 
 
 		 716 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  28.29 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  28.29 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 777 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  31.54 
 
 		 758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  26.9 
 
 		 897 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  30.33 
 
 		 675 aa  131  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  29.26 
 
 		 703 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  28.92 
 
 		 704 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  30.75 
 
 		 748 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  30.31 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  29.01 
 
 		 672 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  31.61 
 
 		 703 aa  128  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  27.36 
 
 		 892 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  30.98 
 
 		 580 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  28.2 
 
 		 717 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 696 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  31.03 
 
 		 658 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  30.9 
 
 		 696 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  28.87 
 
 		 805 aa  126  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  31.67 
 
 		 797 aa  126  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  28.23 
 
 		 670 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.14 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 640 aa  125  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  27.11 
 
 		 783 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  29.68 
 
 		 803 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  28.18 
 
 		 794 aa  124  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.88 
 
 		 686 aa  124  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.88 
 
 		 686 aa  124  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  29.31 
 
 		 987 aa  124  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>