24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1244 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  217  4e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  74.29 
 
 
106 aa  162  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  70.75 
 
 
106 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  65.09 
 
 
106 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  65 
 
 
107 aa  136  8e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  52.48 
 
 
105 aa  103  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  49.5 
 
 
115 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 
106 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  49.51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  49.51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  47.57 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  48.91 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  44.12 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  47.73 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  42.16 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 
104 aa  52  2e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 
103 aa  51.2  5e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0600  hypothetical protein  59.09 
 
 
137 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236988  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  50.1  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 
104 aa  48.9  2e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 
107 aa  48.5  3e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  32.63 
 
 
106 aa  47.8  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  31.58 
 
 
106 aa  47.8  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  29.76 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>