24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1244 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  74.29 
 
 		 106 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  70.75 
 
 		 106 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  65.09 
 
 		 106 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  65 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  52.48 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  49.5 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  49.51 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  49.51 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  47.57 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  48.91 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  44.12 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  47.73 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  42.16 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0600  hypothetical protein  59.09 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  29.76 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>