79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1209 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 337 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  86.77 
 
 		 334 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  81.1 
 
 		 329 aa  547  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  72.56 
 
 		 324 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  73.82 
 
 		 325 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  66.88 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.88 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  66.88 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  64.04 
 
 		 326 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  63.72 
 
 		 333 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  64.04 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.26 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  67.64 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  55.49 
 
 		 322 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  55.91 
 
 		 322 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  55.91 
 
 		 322 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  56.29 
 
 		 325 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  56.29 
 
 		 325 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  56.29 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  44.3 
 
 		 295 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  27.96 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  28.41 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  25.7 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  23.83 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.59 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.78 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  24.24 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.96 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.57 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.28 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  25.38 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.16 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  24.14 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  24 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  21.61 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.7 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.7 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.51 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.89 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.96 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.96 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.28 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  21.29 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  21.29 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.48 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  21.28 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  22.29 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  23.57 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.26 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  21.15 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  24.24 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.86 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.97 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  23 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.04 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.36 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  27.66 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  21.61 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  22.76 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  24.14 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.07 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.61 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.96 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  23.72 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  20.97 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  23.22 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  23.76 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  25.76 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.57 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  21.61 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  26.27 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  23.12 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  20.52 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.77 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>