More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1092 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
464 aa  919    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 
462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  54.75 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
445 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  52.51 
 
 
445 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 
457 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 
444 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  47.23 
 
 
454 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  46.58 
 
 
454 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
458 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  45.6 
 
 
473 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  45.7 
 
 
481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.08 
 
 
454 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
465 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 
470 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
494 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.81 
 
 
484 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
494 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
482 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
482 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  38.48 
 
 
443 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
479 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
449 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  42.81 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  37.63 
 
 
443 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  42.14 
 
 
461 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
463 aa  209  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.52 
 
 
446 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
480 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  39.62 
 
 
431 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  40.72 
 
 
480 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
480 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  39.94 
 
 
482 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  39.94 
 
 
482 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  39.94 
 
 
482 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  40.26 
 
 
482 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
461 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
475 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  39.61 
 
 
482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
468 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
468 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
468 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  39.74 
 
 
475 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
480 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
467 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.78 
 
 
463 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  38.44 
 
 
463 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
468 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
473 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
458 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
460 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
461 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  38.69 
 
 
470 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.85 
 
 
462 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
458 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  30.96 
 
 
476 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
476 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
477 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
465 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
462 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
462 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
469 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
469 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
471 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  30.97 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.34 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  36.67 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  36.67 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.79 
 
 
466 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  38.19 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
472 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
472 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
472 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
477 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
481 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
481 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
474 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
474 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
474 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  31.59 
 
 
463 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  36.45 
 
 
491 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  34.47 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.83 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>