More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1048 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  91.67 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  91.67 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  92.5 
 
 		 134 aa  227  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  90.83 
 
 		 132 aa  223  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  85.38 
 
 		 132 aa  221  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  81.4 
 
 		 133 aa  213  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  78.95 
 
 		 133 aa  213  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  79.55 
 
 		 132 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  79.55 
 
 		 132 aa  209  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  80.65 
 
 		 132 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  84.75 
 
 		 132 aa  206  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  82.5 
 
 		 131 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  83.9 
 
 		 131 aa  204  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  81.67 
 
 		 131 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  82.2 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  77.6 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  76.8 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  76.8 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  76.8 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  76.8 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  81.36 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  76.8 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  76.8 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  79.66 
 
 		 130 aa  196  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  79.66 
 
 		 130 aa  196  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  79.17 
 
 		 129 aa  196  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  79.17 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  79.66 
 
 		 131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  72.66 
 
 		 131 aa  190  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 		 130 aa  189  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  71.09 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  70 
 
 		 130 aa  186  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  70.08 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  68.46 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  71.65 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  71.65 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  70.31 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  71.65 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  71.65 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  68.46 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  71.65 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  71.09 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  73.33 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  72.8 
 
 		 125 aa  183  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  71.65 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  75.83 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  71.43 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  67.97 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  73.73 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  69.35 
 
 		 132 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  68.8 
 
 		 132 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  68.46 
 
 		 130 aa  176  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  71.19 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  71.19 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  71.19 
 
 		 133 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  66.15 
 
 		 130 aa  173  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  69.05 
 
 		 128 aa  173  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  71.19 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  69.23 
 
 		 128 aa  173  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  69.05 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  66.93 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  69.67 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>