More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1042 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  88.33 
 
 
437 aa  749  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  76.15 
 
 
445 aa  663  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  78.54 
 
 
447 aa  669  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3498  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3784  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3756  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.132887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3726  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0105177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3048  preprotein translocase subunit SecY  78.97 
 
 
448 aa  656  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  78.54 
 
 
447 aa  667  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1944  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
439 aa  878  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  76.55 
 
 
442 aa  668  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2930  preprotein translocase subunit SecY  78.9 
 
 
440 aa  667  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  7.99077e-06 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  95.67 
 
 
439 aa  821  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  94.47 
 
 
437 aa  793  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0334  preprotein translocase subunit SecY  76.92 
 
 
448 aa  649  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507904  decreased coverage  0.00438746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  92.24 
 
 
439 aa  768  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  75.88 
 
 
440 aa  647  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  6.31755e-08  hitchhiker  3.21163e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  79.03 
 
 
441 aa  706  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  89.45 
 
 
436 aa  775  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  95.44 
 
 
439 aa  817  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  81.11 
 
 
440 aa  720  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  7.06243e-08 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2612  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3624  preprotein translocase subunit SecY  76.92 
 
 
448 aa  649  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0024204  hitchhiker  3.16341e-11 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2999  preprotein translocase subunit SecY  79.13 
 
 
448 aa  670  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0377089  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  95.44 
 
 
439 aa  817  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  93.55 
 
 
435 aa  770  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3149  preprotein translocase subunit SecY  78.74 
 
 
448 aa  640  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0275585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  85.06 
 
 
436 aa  733  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  79.77 
 
 
437 aa  689  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2819  preprotein translocase subunit SecY  77.6 
 
 
448 aa  654  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83211  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  87.61 
 
 
436 aa  754  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3277  preprotein translocase subunit SecY  78.9 
 
 
440 aa  666  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821024  hitchhiker  0.000244814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0368  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 
449 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0269  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 
449 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432413  normal  0.0196675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2739  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 
449 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0287  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 
449 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0347  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 
449 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85548  normal  0.204606 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0070  preprotein translocase, SecY subunit  74.6 
 
 
445 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.314815  hitchhiker  4.14881e-11 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3467  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 
449 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131731  normal  0.0863023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0296  preprotein translocase subunit SecY  77.99 
 
 
425 aa  612  1e-174  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000308109  normal  0.0856624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  67.59 
 
 
453 aa  601  1e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  68.38 
 
 
434 aa  602  1e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  66.9 
 
 
446 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.81445e-07  unclonable  1.05897e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  65.75 
 
 
439 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  67.13 
 
 
446 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  67.13 
 
 
446 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  66.9 
 
 
446 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  67.83 
 
 
446 aa  591  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.14541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  67.22 
 
 
437 aa  591  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  67.68 
 
 
441 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  67.6 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.58721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  67.6 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.5492e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  66.67 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.2283e-06  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  67.6 
 
 
446 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.11222e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  67.6 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.84742e-08  unclonable  4.35138e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  67.6 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.98254e-06  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  66.44 
 
 
446 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  67.37 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.62692e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  66.06 
 
 
444 aa  587  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  66.67 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.10874e-07  hitchhiker  1.76689e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  66.9 
 
 
446 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.05107e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  66.67 
 
 
446 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.44124e-08  unclonable  3.04117e-11 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  67.14 
 
 
434 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  64.6 
 
 
440 aa  577  1e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  69.57 
 
 
451 aa  576  1e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  67.76 
 
 
448 aa  574  1e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  65.73 
 
 
443 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0478  preprotein translocase subunit SecY  67.13 
 
 
447 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  62.99 
 
 
443 aa  564  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  62.85 
 
 
444 aa  563  1e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  63.36 
 
 
442 aa  562  1e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  63.06 
 
 
442 aa  561  1e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  62.62 
 
 
443 aa  563  1e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  62.62 
 
 
443 aa  563  1e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  63.06 
 
 
442 aa  561  1e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  62.62 
 
 
443 aa  562  1e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  4.33507e-06 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  64.55 
 
 
444 aa  564  1e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.28975e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  62.85 
 
 
444 aa  563  1e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  64.32 
 
 
444 aa  562  1e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  62.62 
 
 
443 aa  561  1e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  63.12 
 
 
442 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.98122e-06  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  65.47 
 
 
443 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.93642e-05  unclonable  4.48849e-12 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  63.49 
 
 
443 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  64.09 
 
 
444 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.17062e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  63.49 
 
 
443 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3783  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.51768e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3689  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.159408  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3595  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0292752  normal  0.0168396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03151  protein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0325718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3981  preprotein translocase subunit SecY  67.52 
 
 
443 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3685  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.23554e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4623  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.34636e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0413  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.27015e-05  unclonable  2.11657e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3787  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.013355  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3731  preprotein translocase subunit SecY  68.21 
 
 
443 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00374977  hitchhiker  0.00528746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03102  hypothetical protein  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0208671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3616  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000240741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3494  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.69315e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3616  preprotein translocase subunit SecY  67.98 
 
 
443 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00028758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>