More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1007 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  100 
 
 		 332 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  50.17 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  49.66 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  49.83 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  48.03 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  44.63 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  44.95 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  44.63 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  43.71 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  37.62 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  48.42 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  46.44 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  46.69 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  44.26 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  43.38 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  44.55 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  44.9 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.69 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  47.21 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  40.33 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  41.33 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  39.7 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  38.96 
 
 		 344 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  42.28 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  40.48 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  37.79 
 
 		 415 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  37.2 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  36.45 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  34.92 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  37.66 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  32.72 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.86 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  33.21 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  33.21 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  33.21 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  33.21 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  33.33 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.35 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  43.11 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  43.71 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  44.06 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  36.42 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  36.42 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  31.35 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  33.21 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  33.33 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  31.31 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  36.67 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  34.67 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  34.01 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  34.33 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  32.29 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  25.42 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  27.15 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  28.14 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.38 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  28.08 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.8 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  23.78 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.8 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.8 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  25.08 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.85 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  25.86 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  23.55 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.52 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  28.08 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.08 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.08 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.08 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  23.29 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  23.29 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  23.29 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  25 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  23.29 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  24.75 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  23.29 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  27.7 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.7 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.32 
 
 		 644 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.7 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  25.16 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  27.7 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.7 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>