More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0957 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  69.35 
 
 
278 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  62.73 
 
 
278 aa  348  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  63.42 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  63.42 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
285 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  61.87 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  48.16 
 
 
318 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  49.1 
 
 
294 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
294 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
297 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
286 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
324 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  48.21 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  49.11 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  49.11 
 
 
298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  49.11 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
284 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
284 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
314 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
314 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
285 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
285 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
285 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
285 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
285 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
316 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  48.74 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  46.83 
 
 
285 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
268 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  36.13 
 
 
278 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
261 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  39.04 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  38.25 
 
 
277 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
268 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
260 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  38.91 
 
 
267 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
261 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
260 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 
259 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.5 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 
267 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
267 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 
265 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
260 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  29.6 
 
 
249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  31.27 
 
 
303 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 
308 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
274 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
275 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
262 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
261 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
275 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
275 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
275 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 
267 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.03 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
263 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  34.31 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.94 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  34.58 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>