More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0887 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  58.46 
 
 		 732 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.15 
 
 		 834 aa  904    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  63.37 
 
 		 857 aa  920    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  60.15 
 
 		 743 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.5 
 
 		 846 aa  897    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  55.73 
 
 		 686 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  58.09 
 
 		 810 aa  869    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 839 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 839 aa  900    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 844 aa  900    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  58.83 
 
 		 698 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  64.19 
 
 		 850 aa  968    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  60.62 
 
 		 846 aa  895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 928 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 841 aa  1704    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  62.76 
 
 		 857 aa  904    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  59.42 
 
 		 742 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  61.73 
 
 		 862 aa  920    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  62.76 
 
 		 858 aa  923    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  62.03 
 
 		 846 aa  903    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 844 aa  900    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  65.24 
 
 		 787 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  60 
 
 		 743 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  63.42 
 
 		 821 aa  910    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  57.81 
 
 		 678 aa  751    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  65.36 
 
 		 801 aa  878    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  62.73 
 
 		 838 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  62.78 
 
 		 888 aa  892    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  66.2 
 
 		 826 aa  961    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  60.15 
 
 		 743 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  62.76 
 
 		 857 aa  904    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  59.85 
 
 		 787 aa  819    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 844 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  63.22 
 
 		 870 aa  919    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  59.03 
 
 		 728 aa  809    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  65.29 
 
 		 844 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  50 
 
 		 783 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  40.38 
 
 		 750 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.6 
 
 		 743 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  38.59 
 
 		 774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  38.36 
 
 		 730 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  37.55 
 
 		 815 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  36.4 
 
 		 850 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.23 
 
 		 740 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  37.34 
 
 		 755 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.98 
 
 		 786 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  58.25 
 
 		 675 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.03 
 
 		 762 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  35.87 
 
 		 759 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.93 
 
 		 752 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  35.04 
 
 		 760 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.39 
 
 		 762 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  34.82 
 
 		 854 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  34.7 
 
 		 786 aa  411  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 768 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  36.14 
 
 		 765 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  33.9 
 
 		 785 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  37.13 
 
 		 767 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  34.49 
 
 		 794 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  34.41 
 
 		 772 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.04 
 
 		 907 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.6 
 
 		 776 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.88 
 
 		 773 aa  379  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  31.8 
 
 		 777 aa  320  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  31.86 
 
 		 809 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  32.29 
 
 		 778 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  31.45 
 
 		 819 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  30.66 
 
 		 792 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  31.5 
 
 		 819 aa  306  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  30.94 
 
 		 819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  30.44 
 
 		 823 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.45 
 
 		 791 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 793 aa  304  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  31.18 
 
 		 819 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  30.59 
 
 		 797 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  30.24 
 
 		 794 aa  302  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  30.24 
 
 		 779 aa  301  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  32.32 
 
 		 790 aa  300  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  30.87 
 
 		 830 aa  297  7e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  29.66 
 
 		 801 aa  297  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 810 aa  297  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  31.15 
 
 		 833 aa  296  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  31.15 
 
 		 805 aa  296  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 		 778 aa  295  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  28.88 
 
 		 823 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  30.82 
 
 		 805 aa  295  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  29.8 
 
 		 791 aa  295  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  29.04 
 
 		 823 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.35 
 
 		 795 aa  293  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  30.03 
 
 		 794 aa  293  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  31.57 
 
 		 679 aa  293  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  31.47 
 
 		 808 aa  293  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  30.03 
 
 		 794 aa  292  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  30.53 
 
 		 805 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  30.25 
 
 		 777 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  30.25 
 
 		 777 aa  290  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  30.2 
 
 		 818 aa  290  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  30.9 
 
 		 790 aa  289  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 766 aa  289  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  29.62 
 
 		 805 aa  288  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>