More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0863 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 647 aa  1342    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.59 
 
 		 585 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 1106 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 		 1106 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 776 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 776 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.63 
 
 		 821 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 821 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 776 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 776 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.85 
 
 		 790 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 776 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 790 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 1143 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 717 aa  278  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  33.69 
 
 		 1116 aa  278  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 717 aa  277  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 713 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 589 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 		 699 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.64 
 
 		 708 aa  266  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.95 
 
 		 797 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 627 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 968 aa  257  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.65 
 
 		 937 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 		 715 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 779 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29 
 
 		 739 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.78 
 
 		 781 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.39 
 
 		 780 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 780 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 1714 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.6 
 
 		 1144 aa  247  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 734 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 708 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 		 667 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 3035 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  32.63 
 
 		 552 aa  238  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 723 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.36 
 
 		 742 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 796 aa  236  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 909 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.05 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.07 
 
 		 739 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 828 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 750 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 718 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1085 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.88 
 
 		 816 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 619 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 789 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 824 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 3560 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 595 aa  223  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.64 
 
 		 739 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 974 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 822 aa  220  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 808 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 598 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.4 
 
 		 740 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 754 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  33.85 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 789 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  27.9 
 
 		 1221 aa  214  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1094 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 739 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 754 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 633 aa  210  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 732 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 828 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 828 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 4489 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.91 
 
 		 596 aa  204  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 833 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 833 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 632 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 647 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 761 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.43 
 
 		 921 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.27 
 
 		 1415 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 618 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 693 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 700 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 706 aa  177  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  28.03 
 
 		 657 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 740 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 		 560 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 732 aa  174  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 667 aa  173  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 733 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 616 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 660 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  31.59 
 
 		 657 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 672 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>