More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0860 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  67.3 
 
 		 554 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  68.69 
 
 		 521 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  68.88 
 
 		 521 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 541 aa  1079    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  55.11 
 
 		 548 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  52.49 
 
 		 521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  60.19 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  50.19 
 
 		 549 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  50 
 
 		 514 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  53.44 
 
 		 533 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  53.08 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  35.32 
 
 		 605 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  35.97 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  36.42 
 
 		 567 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  36.22 
 
 		 569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  48.12 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 		 565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  36.89 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  44.61 
 
 		 564 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  43.87 
 
 		 593 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  43.12 
 
 		 589 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  43.49 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  43.49 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  43.49 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  43.49 
 
 		 589 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  44.24 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  43.49 
 
 		 589 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  43.49 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  43.49 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  44.24 
 
 		 564 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  43.48 
 
 		 562 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  44.24 
 
 		 588 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  44.24 
 
 		 588 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  43.87 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 		 502 aa  196  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  32.05 
 
 		 590 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  42.16 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  37.39 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  37.04 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  31.27 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  28.74 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  30.38 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  28.57 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  27.45 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 		 488 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  28.57 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  36.53 
 
 		 480 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  34.85 
 
 		 483 aa  143  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  29.34 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.51 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  29.56 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  30.08 
 
 		 489 aa  136  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  30.93 
 
 		 481 aa  136  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  30.74 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  29.56 
 
 		 489 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  29.82 
 
 		 489 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  29.15 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  28.96 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  34.63 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  36.9 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 486 aa  133  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  30.35 
 
 		 477 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  31.66 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  30.69 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 		 268 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  28.94 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  33.05 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  33.88 
 
 		 561 aa  130  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  37.94 
 
 		 478 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 		 268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  39.27 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  31.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  31.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  33.74 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  31.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  31.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  31.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  31.83 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  31.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.01 
 
 		 487 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 		 487 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  29.08 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  28.74 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  31.55 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  35.2 
 
 		 477 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  28.74 
 
 		 478 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  31.55 
 
 		 487 aa  127  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>