50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0829 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  67.57 
 
 		 111 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  67.57 
 
 		 111 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  58.56 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  72.55 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  59.8 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  57.55 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  50.94 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  53.92 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  57.28 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  32.08 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  38.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  38.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  39.33 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  36.79 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  38.2 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  37.93 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  28.26 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  29.59 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  32 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  31.91 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  35.87 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  28.28 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  25.51 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  25.51 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>