More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0724 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0724  porin  100 
 
 		 348 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  74.43 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  40.4 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  40.84 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  39.16 
 
 		 426 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  39.46 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  40.9 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  40.59 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  40.75 
 
 		 414 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  41.74 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  41.05 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  38.69 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  40.33 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  39.27 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  41.87 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  37.1 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  37.37 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  37.08 
 
 		 374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  37.33 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  38.57 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  37.53 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  39.24 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.76 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  36.17 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  37.54 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  34.14 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  35.69 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.62 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  34.69 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  33.6 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  33.53 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  31.93 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.33 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  33.04 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  33.44 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  30.97 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.36 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.36 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  33.72 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.46 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  31.78 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.34 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.12 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  29.56 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  29.78 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  29.78 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.04 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  33.62 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  28.94 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.93 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.66 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  32.39 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  31.2 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  32.39 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  31.2 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  31.2 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.35 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.7 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  30.43 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  29.32 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  31.5 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  27.65 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.87 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  32.11 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  32.47 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  29.46 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  29.14 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  31.99 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  29.21 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  30.87 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  30.05 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.34 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  29.03 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  30.98 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  26.87 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  31.65 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  29.87 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  32.88 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  31.45 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29.69 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.25 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  31.47 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  30.43 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  28.57 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  31.18 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.58 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  29.27 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  30.45 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  32.08 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  29.79 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  29.14 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  30.53 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  30.45 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.64 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  29.44 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  29.75 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.16 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  27.96 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  33.59 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>