159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0671 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
216 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  68.66 
 
 
216 aa  311  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  68.66 
 
 
216 aa  311  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  66.67 
 
 
218 aa  292  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  59.53 
 
 
223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  57.8 
 
 
220 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  55.09 
 
 
220 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  56.05 
 
 
224 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  49.31 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  48.66 
 
 
221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  47.93 
 
 
214 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  44.34 
 
 
214 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  45.36 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  41.83 
 
 
211 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  41.21 
 
 
212 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  42.22 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  40.19 
 
 
215 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  41.76 
 
 
215 aa  168  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  41.71 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.94 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.4 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  41.44 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  41.4 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  40.86 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  40.32 
 
 
213 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  41.62 
 
 
212 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 
210 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.34 
 
 
211 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  39.61 
 
 
210 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
218 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
211 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.86 
 
 
211 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.32 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
215 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  40.11 
 
 
218 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.39 
 
 
214 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 
212 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 
212 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  39.77 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  39.04 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  40.88 
 
 
218 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 
213 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  40.43 
 
 
211 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.8 
 
 
214 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  39 
 
 
225 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.12 
 
 
216 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
210 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  33.83 
 
 
206 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  37.99 
 
 
293 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 
233 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 
220 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  34.57 
 
 
271 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  33.86 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 
260 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  34.39 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  35.14 
 
 
216 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.37 
 
 
213 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
207 aa  104  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
216 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 
211 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  32.5 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  30.48 
 
 
215 aa  89  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.18 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  27.07 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  30 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.76 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.95 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.87 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.28 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.42 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>