More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0660 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  70.45 
 
 		 641 aa  878    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  78.82 
 
 		 628 aa  963    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  60.93 
 
 		 648 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 636 aa  752    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  76.35 
 
 		 629 aa  937    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  62.23 
 
 		 688 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  60.93 
 
 		 648 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  70.87 
 
 		 645 aa  849    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  56.11 
 
 		 646 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  61.82 
 
 		 640 aa  739    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  63.84 
 
 		 642 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  60.93 
 
 		 660 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  60.93 
 
 		 1065 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  62.07 
 
 		 649 aa  748    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  72.6 
 
 		 635 aa  868    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 660 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  61.92 
 
 		 649 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  100 
 
 		 626 aa  1264    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  54.29 
 
 		 640 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  61.92 
 
 		 649 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  61.24 
 
 		 648 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  61.82 
 
 		 648 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  60.93 
 
 		 648 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  63.41 
 
 		 636 aa  755    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  70.25 
 
 		 629 aa  867    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  57.08 
 
 		 648 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  69.71 
 
 		 648 aa  875    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  61.65 
 
 		 645 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  63.72 
 
 		 663 aa  757    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  64.72 
 
 		 632 aa  771    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  62.74 
 
 		 641 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  61.19 
 
 		 641 aa  747    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  62.07 
 
 		 661 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  67.57 
 
 		 626 aa  793    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  61.61 
 
 		 649 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  62.07 
 
 		 661 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 660 aa  729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  79.3 
 
 		 628 aa  968    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  62.03 
 
 		 634 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  54.5 
 
 		 644 aa  611  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  54.03 
 
 		 631 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 632 aa  586  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.82 
 
 		 653 aa  571  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  49.92 
 
 		 650 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  47.42 
 
 		 640 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 638 aa  558  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  44.87 
 
 		 648 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  44.87 
 
 		 648 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  44.11 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  49.44 
 
 		 627 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  47.46 
 
 		 643 aa  538  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  44.53 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  44.53 
 
 		 640 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  44.53 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  44.27 
 
 		 641 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  47.96 
 
 		 635 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  44.69 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  43.44 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 646 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  43.44 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  43.44 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  43.44 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  47.08 
 
 		 641 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.87 
 
 		 615 aa  527  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  45.27 
 
 		 635 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  44.15 
 
 		 639 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  45.31 
 
 		 639 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  47.72 
 
 		 631 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  45.78 
 
 		 639 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  44.81 
 
 		 635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  45.67 
 
 		 642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 		 639 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  45.63 
 
 		 623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.27 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  48.43 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  45.27 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  46.99 
 
 		 642 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  45.27 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  45.27 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  43.33 
 
 		 637 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  43.33 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  45.44 
 
 		 639 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  45.43 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  43.33 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 620 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  46.65 
 
 		 620 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  45.75 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  45.27 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  43.23 
 
 		 638 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 637 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 633 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  47.43 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  44.16 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  47.43 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  43.01 
 
 		 638 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  42.55 
 
 		 645 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  44.16 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  44.16 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>