38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0647 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 		 111 aa  213  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  70 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  70 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  52.34 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  58.23 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  46.67 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  45.98 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  48.1 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  44.79 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  36.27 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  48.05 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.46 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.98 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  43.82 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  43.82 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.94 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  41.18 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.22 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  35.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.78 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  28.28 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.67 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  37.97 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.93 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  34.18 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.86 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.82 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  39.24 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.35 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  31.82 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.78 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>