123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0640 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
303 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  55.73 
 
 
244 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  55.21 
 
 
244 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  56.28 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  55.08 
 
 
247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  41.95 
 
 
227 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  35.59 
 
 
261 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  32.69 
 
 
231 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  32.98 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  34.18 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  30.96 
 
 
209 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.51 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.81 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  34.71 
 
 
201 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  33.66 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  31.32 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.89 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  30.85 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  32.47 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  30.43 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  32.11 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  33.71 
 
 
227 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  33.52 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  32.37 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  33.14 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  32.12 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  32.57 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  33.14 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  29.76 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.32 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  30.86 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  25.85 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  34.22 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  32 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  32 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.38 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.75 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  24.58 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  26.82 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  26.29 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  32.91 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  31.67 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  24.86 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  25.42 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  35.83 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  26.04 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  24.43 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  30.43 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  30.43 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  24.58 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  30.99 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  31.52 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  31.95 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  37.74 
 
 
227 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  30.91 
 
 
238 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  30.91 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  37.74 
 
 
227 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  31.06 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  24.07 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.43 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  28.19 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  23.95 
 
 
265 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  30.06 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.86 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.86 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  25.14 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  24.57 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  28.05 
 
 
236 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  25.71 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  23.64 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  27.66 
 
 
251 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.67 
 
 
269 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  26.4 
 
 
236 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  26.63 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.22 
 
 
243 aa  55.8  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.33 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.86 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  26.26 
 
 
213 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  25.23 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.07 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.05 
 
 
231 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  21.69 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>