266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0638 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 566 aa  1133    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  65.3 
 
 		 564 aa  680    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  67.07 
 
 		 566 aa  741    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  65.3 
 
 		 564 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  62.48 
 
 		 562 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  58.47 
 
 		 588 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  53.51 
 
 		 567 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  53.73 
 
 		 576 aa  534  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  48.24 
 
 		 567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  44.44 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  43.64 
 
 		 611 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  43.64 
 
 		 611 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  45.42 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  42.54 
 
 		 600 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  42.43 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  43.24 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  43.81 
 
 		 677 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  43.85 
 
 		 563 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  41.7 
 
 		 603 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  43.47 
 
 		 598 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  43.46 
 
 		 587 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  42.88 
 
 		 584 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  42.83 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  42.83 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  43.46 
 
 		 587 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  43.46 
 
 		 587 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  42.86 
 
 		 593 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  42.64 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  42.64 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  43.82 
 
 		 587 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  42.65 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  42.64 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  42.64 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  42.65 
 
 		 587 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  43.86 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  40.47 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  40.81 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  40.81 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  40.47 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  40.47 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  40.47 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  40.47 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  42.12 
 
 		 563 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  41.79 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  40.81 
 
 		 570 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  40.67 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  40.29 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  41.4 
 
 		 569 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  40.48 
 
 		 579 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  40.67 
 
 		 579 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  40.48 
 
 		 579 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  40.48 
 
 		 576 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  39.37 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  44.25 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  41.1 
 
 		 569 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  38.86 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  39.53 
 
 		 574 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  39.89 
 
 		 552 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  40.13 
 
 		 594 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  38.15 
 
 		 576 aa  333  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  38.33 
 
 		 567 aa  321  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  35.14 
 
 		 561 aa  316  6e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  35.45 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  36.04 
 
 		 592 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 		 597 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  35.8 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  35.39 
 
 		 595 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  35.8 
 
 		 592 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.63 
 
 		 580 aa  299  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  34.44 
 
 		 558 aa  290  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  36.17 
 
 		 556 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  35.34 
 
 		 592 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  34.81 
 
 		 594 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.57 
 
 		 594 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  35.27 
 
 		 594 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  31.46 
 
 		 544 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  31.65 
 
 		 544 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  33.74 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  31.93 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  34.44 
 
 		 548 aa  264  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  33.46 
 
 		 525 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  32.17 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  32.29 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  34.85 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  34.85 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  35.07 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 		 568 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.72 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  35.6 
 
 		 527 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.27 
 
 		 519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.76 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  31.42 
 
 		 530 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.71 
 
 		 538 aa  242  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.29 
 
 		 539 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  34.34 
 
 		 578 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.47 
 
 		 539 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 		 566 aa  229  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  34.82 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  35.57 
 
 		 572 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>