More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0616 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 974 aa  1964    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 1143 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 		 781 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.54 
 
 		 790 aa  324  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 776 aa  323  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.97 
 
 		 821 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 776 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  33.07 
 
 		 790 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 776 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 776 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 776 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 780 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.58 
 
 		 780 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 1116 aa  310  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.41 
 
 		 797 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 779 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 754 aa  264  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 789 aa  263  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.44 
 
 		 739 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 754 aa  262  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 1144 aa  259  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 789 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 968 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  29.06 
 
 		 937 aa  245  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1106 aa  244  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 627 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 713 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.57 
 
 		 1106 aa  238  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 824 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 589 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.58 
 
 		 715 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.38 
 
 		 585 aa  234  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 828 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 796 aa  233  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 718 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.21 
 
 		 699 aa  228  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 734 aa  228  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.84 
 
 		 1221 aa  227  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 647 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.64 
 
 		 740 aa  226  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 		 589 aa  224  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 717 aa  224  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 828 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 708 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 828 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.86 
 
 		 739 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.54 
 
 		 739 aa  218  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.51 
 
 		 708 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 717 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 822 aa  215  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.52 
 
 		 742 aa  211  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 727 aa  207  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1714 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 626 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 739 aa  204  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.34 
 
 		 816 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.26 
 
 		 921 aa  202  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 723 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 833 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 633 aa  199  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 909 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.79 
 
 		 1415 aa  198  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 693 aa  197  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 732 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 833 aa  196  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 808 aa  194  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 595 aa  194  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 598 aa  194  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.68 
 
 		 596 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 667 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 750 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 700 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 4489 aa  172  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 667 aa  171  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 793 aa  170  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  26.48 
 
 		 553 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 733 aa  163  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 3560 aa  163  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1085 aa  163  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 3035 aa  162  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  29.27 
 
 		 630 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 750 aa  156  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  30.7 
 
 		 552 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1094 aa  154  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 706 aa  154  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 672 aa  149  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 654 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 732 aa  145  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 761 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  28.77 
 
 		 633 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  28.25 
 
 		 566 aa  139  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 616 aa  137  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 740 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.3 
 
 		 1154 aa  130  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  28.27 
 
 		 637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>