196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0591 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  75.33 
 
 
224 aa  345  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  74.01 
 
 
223 aa  344  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  74.01 
 
 
223 aa  344  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  69.6 
 
 
224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  63.44 
 
 
224 aa  284  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  62.56 
 
 
222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  59.91 
 
 
222 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  52.21 
 
 
271 aa  266  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  38.72 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  38.72 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
224 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
224 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 
224 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
224 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 
224 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
225 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  36.91 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
224 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
222 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
236 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  32 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  32.44 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  31.25 
 
 
236 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
236 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
236 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  28.57 
 
 
238 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 
244 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  35.04 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  34.89 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  28.94 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
250 aa  99  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  34.96 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  27.83 
 
 
250 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  27.83 
 
 
250 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  27.83 
 
 
250 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  28.02 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  28.26 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  27.83 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  27.59 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  23.25 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  26.41 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  23.72 
 
 
205 aa  52  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  25.78 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  26.61 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  25.11 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  23.35 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  28.9 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  29.81 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  39.58 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  23.64 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  24.34 
 
 
250 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  23.5 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  27.39 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  37.23 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  27.39 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  27.39 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
232 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  28.57 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  26.09 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  37.23 
 
 
206 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>