More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0561 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
334 aa  678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  77.51 
 
 
343 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  51.15 
 
 
319 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  49.18 
 
 
319 aa  316  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  48.7 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.38 
 
 
324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  50.48 
 
 
339 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  51.94 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
362 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5572  glycosyl transferase family 2  50.33 
 
 
340 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  44.92 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  47.12 
 
 
319 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  47.71 
 
 
360 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  49 
 
 
331 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  44.52 
 
 
310 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  44.92 
 
 
335 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  44.52 
 
 
310 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  47.76 
 
 
332 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  46.65 
 
 
342 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  44.88 
 
 
306 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  44.26 
 
 
308 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  45.93 
 
 
358 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  43.71 
 
 
330 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  47.39 
 
 
339 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  44.26 
 
 
308 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 
330 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  45.93 
 
 
358 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  44.26 
 
 
308 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  43.23 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  44.52 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  43.67 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  45.69 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 
365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 
365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  45.48 
 
 
320 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  46.73 
 
 
339 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
347 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
338 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  45.78 
 
 
327 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  45.03 
 
 
365 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  45.89 
 
 
334 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 
359 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  44.33 
 
 
319 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
340 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  44.44 
 
 
312 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  40.37 
 
 
346 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
319 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  44.52 
 
 
367 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 
347 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  43.37 
 
 
357 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 
348 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.37 
 
 
353 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.37 
 
 
353 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.37 
 
 
353 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 
363 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
347 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  45.03 
 
 
347 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  46.41 
 
 
335 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  44.04 
 
 
353 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  43.14 
 
 
309 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  44.22 
 
 
373 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 
347 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  44.22 
 
 
373 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  43.19 
 
 
330 aa  252  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 
307 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  41.37 
 
 
366 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  43.19 
 
 
330 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  42.53 
 
 
348 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  45.05 
 
 
337 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  42.81 
 
 
309 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  42.38 
 
 
311 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  42.38 
 
 
311 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  44.67 
 
 
337 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 
383 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  42.48 
 
 
309 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  40.84 
 
 
364 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.95 
 
 
332 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
312 aa  245  8e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  40.52 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1844  glycosyl transferase family protein  45.37 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000858357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
321 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  42.05 
 
 
339 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
346 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  38.71 
 
 
343 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
345 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
319 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
310 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 
324 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  35.9 
 
 
312 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
320 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  41.47 
 
 
331 aa  235  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  41.31 
 
 
327 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  42.14 
 
 
336 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>