193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0498 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  100 
 
 		 180 aa  360  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  74.85 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  74.85 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  70.99 
 
 		 183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  76.4 
 
 		 299 aa  233  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  65.61 
 
 		 180 aa  220  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  71.79 
 
 		 288 aa  218  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  72.73 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  61.68 
 
 		 202 aa  204  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  56.52 
 
 		 174 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  59.49 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  51.85 
 
 		 300 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  49.4 
 
 		 298 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  49.68 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  48.19 
 
 		 319 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  49.4 
 
 		 298 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  49.4 
 
 		 297 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  48.48 
 
 		 294 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  45.22 
 
 		 297 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  45.22 
 
 		 302 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 302 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  50 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  43.95 
 
 		 295 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  50 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  43.31 
 
 		 296 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  50 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  43.95 
 
 		 295 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  43.95 
 
 		 295 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  50 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  50 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  50 
 
 		 299 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  47.9 
 
 		 294 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  49.39 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  45.81 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  49.38 
 
 		 300 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  49.64 
 
 		 275 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  51.82 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  37.95 
 
 		 266 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  38.35 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  51.85 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  34.97 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  47.95 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  52.7 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  39.32 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  44.32 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  29.49 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  43.42 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  41.25 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  45.21 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  41.67 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 112 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  39.22 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  48 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  48 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  44.74 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  46.48 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  48.75 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  38.89 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  40.54 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  32.73 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  32.73 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  39.74 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  34.45 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  34.45 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  38.96 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  41.03 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  45 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  43.9 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2118  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343097  normal  0.41454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  30.13 
 
 		 287 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  41.33 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  45.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  37.04 
 
 		 99 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  43.42 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>