More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0452 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
477 aa  975  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  67.89 
 
 
473 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  45.91 
 
 
470 aa  398  1e-110  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
463 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  41.99 
 
 
468 aa  363  5e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  40.33 
 
 
491 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  40 
 
 
491 aa  358  1e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
462 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  39.79 
 
 
491 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
480 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  40.97 
 
 
480 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  41.18 
 
 
482 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  41 
 
 
482 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  40.97 
 
 
482 aa  343  6e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  40.79 
 
 
482 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  40.79 
 
 
482 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  40.8 
 
 
475 aa  337  2e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
462 aa  329  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  39.48 
 
 
463 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  36.88 
 
 
463 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
461 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
465 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
467 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
458 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
465 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
461 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
456 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  9.553e-07 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
465 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
456 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
469 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
475 aa  285  1e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
468 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
467 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
468 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
468 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
468 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
465 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
467 aa  273  4e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.83 
 
 
466 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.07 
 
 
462 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  39.28 
 
 
431 aa  267  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  36.07 
 
 
459 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
467 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
461 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
480 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
445 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  37.72 
 
 
455 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.07 
 
 
446 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  31.4 
 
 
446 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
450 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  36.46 
 
 
443 aa  246  5e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
449 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  36.64 
 
 
443 aa  245  1e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
450 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  37.23 
 
 
465 aa  245  1e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
480 aa  245  2e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.01 
 
 
464 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.01 
 
 
464 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.37 
 
 
464 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.01 
 
 
464 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.01 
 
 
464 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.01 
 
 
464 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  34.4 
 
 
464 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
486 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  35.37 
 
 
715 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
466 aa  239  7e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
481 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
455 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
493 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
486 aa  235  1e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
486 aa  235  1e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
493 aa  234  2e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.83 
 
 
468 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.5 
 
 
483 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
464 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.86 
 
 
469 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  32.03 
 
 
454 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
486 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  32.47 
 
 
454 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  33.73 
 
 
486 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
471 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
474 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
472 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
468 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
474 aa  223  5e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
474 aa  223  5e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
474 aa  223  5e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
487 aa  223  5e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
472 aa  222  1e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
472 aa  222  1e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
472 aa  222  1e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  32.49 
 
 
484 aa  221  2e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
472 aa  221  2e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  35.73 
 
 
467 aa  221  2e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
465 aa  221  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
462 aa  221  2e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  32.49 
 
 
484 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
458 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
469 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
469 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>