More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0339 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 267 aa  564  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  83.52 
 
 		 267 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  84.85 
 
 		 264 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  83.52 
 
 		 267 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  76.52 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  73.03 
 
 		 267 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  76.78 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  60.76 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  67.67 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  67.04 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  59.4 
 
 		 257 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  59.02 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  59.02 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  59.02 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  58.65 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  58.65 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  57.89 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  57.2 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.58 
 
 		 257 aa  321  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  57.3 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  56.93 
 
 		 259 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  56.72 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  56.55 
 
 		 259 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  56.18 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  58.11 
 
 		 258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  56.13 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  57.46 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  57.46 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.33 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.46 
 
 		 258 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  54.34 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0216  exodeoxyribonuclease III (xth)  71.13 
 
 		 349 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  51.88 
 
 		 259 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  48.12 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  48.11 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  47.41 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  47.17 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  47.17 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  44.85 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  43.38 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  46.47 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  43.01 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.72 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  41.39 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  44.24 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  41.97 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.35 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  39.05 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  40.29 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.26 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  39.69 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1767  exodeoxyribonuclease III Xth  39.15 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  34.35 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  38.32 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000488572 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  40.67 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  36.68 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  34.22 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0618  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000157128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  35.52 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  34.09 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  38.27 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  37.16 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0079  exodeoxyribonuclease III, putative  34.46 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  37.31 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  37.31 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  37.31 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  35.58 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  36.54 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0215  exodeoxyribonuclease III xth  34.08 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  37.4 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6108  catabolite repression control protein  34.44 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.1 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0180  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  hitchhiker  0.00000710685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70390  catabolite repression control protein  34.44 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5545  exodeoxyribonuclease III xth  34.08 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02870  catabolite repression control protein; Crc  35.21 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3205  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0258  exonuclease III  36.93 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>