More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0312 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  30.4 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  30.91 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 321 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  38.36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  38.36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  38.36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  38.36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  38.36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  27.13 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 175 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.46 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.81 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.68 
 
 		 305 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.97 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  40.62 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 171 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 310 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>