68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0307 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0307  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  100 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0187  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  70.1 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0169  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  69.59 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0459261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0245  hypothetical protein  63.54 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3447  hypothetical protein  47.94 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3812  activator of osmoprotectant transporter  54.38 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1033  hypothetical protein  52.16 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0842196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0862  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  57.37 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  37.11 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000470709  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1105  putative solute/DNA competence effector  37.76 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000947436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  38.3 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  38.64 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2132  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000562228  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2602  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2229  putative solute/DNA competence effector  37.78 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.180207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1672  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000366609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1747  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1777  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205752  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  38.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  39.08 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  39.08 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  42.65 
 
 		 207 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  39.08 
 
 		 211 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1801  putative solute/DNA competence effector  38.64 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1903  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0351843  normal  0.135941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2448  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2561  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  normal  0.0763092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2441  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254744  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2484  putative solute/DNA competence effector  38.64 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000695377  normal  0.223616 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  37.93 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1721  putative solute/DNA competence effector  38.64 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  32.17 
 
 		 121 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  32.17 
 
 		 123 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  37.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  36.78 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  36.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  36.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  36.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  36.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  39.77 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  40 
 
 		 119 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  39.73 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  36.56 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0121  hypothetical protein  29.01 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0127527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  40.3 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  35.37 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3139  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  32 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2570  hypothetical protein  36.47 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000198661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2621  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  29.93 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176786  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7730  ProQ, activator of osmoprotectant transporter ProP  32.22 
 
 		 220 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3555  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  35.53 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  35.53 
 
 		 171 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>