More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0261 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  100 
 
 		 324 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  67.44 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5974  inner-membrane translocator  70.3 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3979  ABC transporter permease  65.56 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  43.81 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.76 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 415 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 562 aa  172  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.03 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.82 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  34.03 
 
 		 832 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  35.74 
 
 		 646 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.08 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.12 
 
 		 646 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  35.96 
 
 		 643 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  35.69 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  34.33 
 
 		 599 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.33 
 
 		 582 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 571 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3553  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.81 
 
 		 830 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0685  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 290 aa  146  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00962366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.58 
 
 		 606 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 381 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  31.8 
 
 		 614 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  31.45 
 
 		 663 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 603 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.05 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  36.84 
 
 		 647 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 603 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.79 
 
 		 603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  32.21 
 
 		 389 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>