More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0236 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  76.44 
 
 		 234 aa  332  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 231 aa  298  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  54.67 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  38.12 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  41.87 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1096  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 251 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  37.38 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3530  transcriptional regulator GntR  35.78 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2161  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111337  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  34.25 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32.27 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3930  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709239  normal  0.547681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4320  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5872  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4006  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2469  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 268 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  33.49 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>