More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0194 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.79 
 
 
264 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  84.03 
 
 
264 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.8 
 
 
260 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.51 
 
 
269 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
287 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
267 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  48.05 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.66 
 
 
264 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
267 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
276 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
264 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
260 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
263 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
259 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
267 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 
261 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
267 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
258 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
268 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
259 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
263 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
270 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
261 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
264 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
262 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
266 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
264 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
263 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
264 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
273 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.92 
 
 
261 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
264 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.85 
 
 
260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
260 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.41 
 
 
263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
266 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
262 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
277 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
268 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
268 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
264 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
256 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
256 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
263 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
260 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
263 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
264 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 
265 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
265 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
268 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
261 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
271 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
258 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.16 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
267 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
263 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
265 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.83 
 
 
260 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
258 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
248 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
275 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
266 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
262 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
269 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
261 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
263 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
270 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
261 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>